La taxonomía de la especie ha sido revisada en numerosas ocasiones y ha generado bastante controversia hasta la reagrupación del género Callicebus en 5 grupos: cupreus, donacophilus, moloch, torquatus y personatus.

Hill (1960) reconoció el taxón como una subespecie de Callicebus gigot y lo agrupó a otras especies de coloración parecida como C. melanochir (gigot), C. pallescens y C. donacophilus. Hershkiovitz (1963) reconoció en un principio la especie como una variación morfológica de Callicebus (moloch) discolor pero más tarde le dio el estatus de especie (Hershkovitz, 1990). Hershkovitz, Groves y Van Roosmalen organizaron las especies del género Callicebus en 5 grupos y encuadraron a C. oenanthe en el grupo donacophilus (Groves, 2001; Hershkovitz, 1990; Van Roosmalen et al., 2002)

En cuanto a la nomenclatura común, inicialmente se utilizó el nombre de Titi Isabellino, pero posteriormente otros autores lo calificaron como Tití del Río Mayo o Tití de los Andes. Sin embargo, la especie no se encuentra distribuida únicamente en las cercanías del río Mayo y sobre todo no se localiza en los Andes, por lo que desde el equipo del Proyecto Mono Tocón proponemos utilizar el nombre de Tití de San Martín o Tocón de San Martín

Este calificativo refleja claramente que la especie se encuentra exclusivamente en la región San Martín. De otro modo, la especie es localmente conocida como mono Tocón o Sugkamat (en lengua awajun).